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如何根据疾病查SNP位点?
SNP4Disease: a knowledge database to detect disease associated SNPs
SNP与疾病相关数据库
链接:
下面是数据库的主页:
我们可以直接根据SNP或者疾病进行查询,比如我们需要查询糖尿病相关的SNP位点,就可以在Disease搜索框中输入Diabetes,会自动跳出选项:
我们选择Diabetes Mellitus,Type 2后单击OK:
就检索到了3789个SNP位点,接下来我们还可以进行筛选,我们单击Next:
在跳出来的选项里面,我们可以选择Gene name等信息,也可以进行filter过滤,比如我们选择第一项Show only GWAS(仅显示GWAS)后单击Search:
结果就出来了:
我们可以根据关心的问题进行检索,比如我们检索FOXO就可以直接出现了FOXO1基因,
我们单击SNP位点、Pubmed ID,EntrezGene ID和UniGene可以查到有关的信息:
除了可以直接检索疾病或者基因外,我们还可以通过基因进行检索:
另外,如果我们关心两个疾病之间的关系,我们还可以查找两个疾病共同的SNP位点:
单击后就可以看到这196个了:
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